Žadatel podává změnové žádosti prostřednictvím Portálu farmáře přes relevantní dlaždice dle typu požadované změny (změny bez předtisku obsahující přílohu, změny s předtiskem LPIS a změny s předtiskem IZR). Každý rok je možné ze strany žadatele podat změnovou žádost až po uplynutí řádného termínu po podání Jednotné žádosti v daném roce a to do data vydání zálohového/standardního rozhodnut a v případě zaslaných výsledků předběžné kontroly (IPK) do konečného termínu pro reakci na výsledky IPK.

Žadatel oznámení o zásahu vyšší moci podá prostřednictvím Portálu farmáře na formuláři „Ohlášení vyšší moci výjimečných okolností na plochu s předtiskem“ nebo „Ohlášení vyšší moci výjimečných okolností mimo plochu bez předtisku“. Spolu s tímto oznámením musí předložit příslušné doklady prokazující mimořádnou okolnost nebo zásah vyšší moci. Podání ohlášení a patřičné dokumenty musí žadatel učinit do 15 dnů ode dne, kdy je tak schopen učinit.

Snížení dotace v rámci Jednotné žádosti v případě pozdního podání

Podání jednotné žádosti po uplynutí stanoveného termínu má za následek snížení částek, na které by měl žadatel nárok, kdyby žádost podal ve stanovené lhůtě, o 1 % za každý pracovní den. Přesáhne-li prodlení žadatele s podáním jednotné žádosti 25 kalendářních dnů, Fond řízení o žádosti zastaví.

Snížení dotace v rámci Jednotné žádosti v případě neohlášení všech ploch

Je-li neuvedena do JŽ veškerá užívaná plocha, Fond sníží dotaci za rozdíl mezi celkovou plochou uvedenou v JŽ a zjištěnou v rámci kontrol takto:  

• větší než 3 %, ale nižší nebo roven 4 % plochy uvedené v JŽ o 1 %,
• větší než 4 %, ale nižší nebo roven 5 % plochy uvedené v JŽ o 2 %,
• větší než 5 % plochy uvedené v JŽ o 3 %.

Snížení dotace v rámci Jednotné žádosti v případě vykázání větší plochy

Je-li plocha uvedená v JŽ pro opatření větší než plocha zjištěná v rámci kontrol, Fond dotaci poskytne na základě plochy zjištěné pro dané opatření takto:

• je- li rozdíl do 0,10 ha (včetně), je dotace poskytnuta na plochu uvedenou v žádosti, 
• je- li rozdíl do 3 % (včetně) zjištěné plochy nebo do 4 ha (včetně), je dotace poskytnuta na skutečnou (zjištěnou) výměru,
• je-li rozdíl větší než 3 % nebo 4 ha, je dotace poskytnuta na zjištěnou výměru dále sníženou, o 1,5 násobek zjištěného rozdílu.

Snížení dotace v rámci Jednotné žádosti v případě vykázání vyššího počtu zvířat

Je-li počet zvířat uvedených v JŽ větší než počet zjištěný v rámci kontroly, Fond dotaci poskytne na základě počtu zjištěných zvířat pro dané opatření takto:

• je- li rozdíl do 3 zvířat (včetně), je dotace poskytnuta na skutečně (zjištěný) počet zvířat, 
• je- li rozdíl větší než 3 a zároveň tento rozdíl není větší než 20 %, sníží se celková částka podpory o procentní podíl,
• je-li rozdíl větší než 20 %, ale není větší než 30 %, sníží se celková částka podpory o dvojnásobek procentního podílu,
• je-li rozdíl větší než 30 %, podpora se zamítne.

Fond žadateli platbu podpory na CIS dojnice, masná telata, bahnice a kozy:

• sníží o 50 %, pokud zjistí, že žadatel porušil § 2, 4, 5 nebo 5b zákona č. 246/1992 Sb., na ochranu zvířat proti týrání, a je mu za to pravomocně uložena pokuta podle tohoto zákona ve výši nad 50 000 Kč do 100 000 Kč,
• neposkytne, pokud zjistí, že žadatel porušil § 2, 4, 5 nebo 5b zákona č. 246/1992 Sb., na ochranu zvířat proti týrání, a je mu za to pravomocně uložena pokuta podle tohoto zákona ve výši nad 100 000 Kč.

Fond také neposkytuje dotaci na plochu bez právního důvodu užívání; o tuto částku Fond dotaci sníží.

Pokud žadatel poruší některý z požadavků/standardů kontroly podmíněnosti, dojde k uplatnění sankce podle nařízení vlády č. 73/2023 Sb., o stanovení pravidel podmíněnosti plateb zemědělcům.